fix: pre-render all non-frozen QMDs to fix babelquarto freeze cache miss

[Copilot]

问题分析 / Root Cause

通过详细分析 CI 日志（run 24491897842），发现 freeze cache 从未被正确保存。

babelquarto::render_website() 内部机制如下（源码）：

render <- function(path = ".", ...) {
    temporary_directory <- withr::local_tempdir()  # 创建临时目录
    fs::dir_copy(path, temporary_directory)         # 复制整个项目到临时目录
    withr::with_dir(file.path(temporary_directory, ...), {
        quarto::quarto_render(...)  # 在临时目录中渲染，_freeze 创建在此
    })
    fs::dir_copy(
        file.path(temporary_directory, ..., output_dir),  # 只把 _site 复制回来
        path
    )
    # render() 返回时，withr 自动删除临时目录（包含 _freeze）
}

根本原因：babelquarto 在临时目录中渲染，将新的 _freeze 条目写入临时目录，然后只把 _site 复制回工作区，最后临时目录被删除。工作区的 _freeze 从未更新，导致 Save freeze cache 步骤只能找到约 6 个 Julia 预渲染条目，而不是 500+ 个。

证据：

• "Save freeze cache" 步骤耗时 0.4 秒（保存 6 个条目），而非几十秒（保存 500+ 个条目）
• 下一次 run 的 "Restore freeze cache" 耗时 1 秒（只有 6 个条目）
• babelquarto 渲染仍然处理 528 个文件并执行所有 R 代码（每次都是）

修复方案 / Fix

在 babelquarto 运行之前，添加"Pre-render all non-frozen QMD files"步骤，直接将 freeze 条目写入工作区的 _freeze 目录：

1. 工作区 _freeze 被完全填充（500+ 条目）
2. babelquarto 通过 fs::dir_copy() 将完整的 _freeze 复制到临时目录
3. babelquarto 内部 filter_freeze_directory() 将 .zh freeze 条目重命名以匹配重命名后的 .qmd 文件
4. babelquarto 调用 quarto::quarto_render() 时，所有文件都有 freeze 条目 → 跳过代码执行，只运行 pandoc
5. Save freeze cache 步骤在工作区找到完整的 _freeze 并保存

预期效果 / Expected Performance

Run type	Before fix	After fix
Cold cache (first run)	~90 min	~95–115 min (slightly slower due to pre-render step then fast babelquarto)
Warm cache (subsequent)	~90 min (full re-render every time!)	~35 min (~3× faster)

其他变更 / Other Changes

• 超时时间从 120 分钟增加到 180 分钟，为冷缓存首次运行提供安全余量
• 更新注释，准确说明 freeze cache 的工作机制

[github-actions]

✅ QMD Format Check

No new QMD tutorial files to check.

Automated check by the PR Review workflow.
See contribution guidance for the expected tutorial format.

[ShixiangWang]

@copilot 是否进行了整个流程的模拟测试和可靠性验证？

[Copilot]

@copilot 是否进行了整个流程的模拟测试和可靠性验证？

没有在真实 CI 上全流程运行（需要约 95-115 分钟），但进行了以下可靠性验证：

1. 根本原因已通过 CI 日志证实

• 上一次成功运行（run 24491897842）中，"Save freeze cache" 步骤耗时 0.4 秒（仅保存 6 个 Julia 条目）
• 下一次运行恢复缓存也只有 6 个条目，babelquarto 仍然重新执行了 528 个文件（~83 分钟）
• 通过阅读 babelquarto 源码确认：render_website() 在 withr::local_tempdir() 中渲染，只把 _site 复制回工作区，_freeze 从不写回

2. 核心逻辑（freeze 路径计算）本地验证通过

冷缓存模拟（无 _freeze）：520 个文件需要渲染，6 个 Julia 跳过 ✓
热缓存模拟（_freeze 已填充）：0 个文件需要渲染，全部跳过 ✓

Distribution/ViolinPlot.qmd    → _freeze/Distribution/ViolinPlot/
Distribution/ViolinPlot.zh.qmd → _freeze/Distribution/ViolinPlot.zh/

3. babelquarto 的 filter_freeze_directory 兼容性验证

• 英文渲染：直接使用 _freeze/Distribution/ViolinPlot/ ✓
• 中文渲染：filter_freeze_directory 将 _freeze/Distribution/ViolinPlot.zh/ 重命名为 _freeze/Distribution/ViolinPlot/，匹配重命名后的 .qmd ✓

4. 已知限制

唯一无法本地验证的是：Quarto 在 babelquarto 的临时目录中，用存储的哈希校验冻结条目时是否正确匹配（文件路径变了但内容相同）。如果出现哈希不匹配，最坏结果是首次运行仍然重新执行代码，但不会报错——后续运行会得到正确的缓存。可在下次 CI 运行时通过观察 "Pre-render all non-frozen QMD files" 步骤的渲染数量和 "Save freeze cache" 的耗时来确认。